钦察汗国初建的时候，拔都有一个弟弟叫昔班，他的封地被称为蓝帐汗国，阿布海尔就是他的后代，阿布海尔有个孙子叫昔班尼。阿布海尔一次征战时战死，昔班尼只得投奔东察合台的马哈木，也就是赛义德的伯父。
马哈木帮助昔班尼收拾残部，重整军马，昔班尼利用帖木儿帝国内讧之机，打败卜撒因的孙子巴布尔汗，占领萨马尔罕城，后来昔班尼攻占呼罗珊、占据赫拉特，整个河中地区与呼罗珊地区都归于他手，贴木儿王朝被终结，在原疆域上，一个昔班尼汗国建立。
昔班尼带来的人，当时被称为月即别人，或乌兹别克人。乌兹别克这个称呼，源于金帐汗国时的乌兹别克汗，元史称他为月即别。金帐汗国曾十分强盛，其咸海以北，不同来源的游牧民，统被称为乌兹别克人。
昔班尼祖父阿布海尔建立的汗国，就被称为乌兹别克，也用乌兹别克指代其汗国境内大多数突厥语系居民。
曾经被赛义德伯父马哈木收留并结盟的昔班尼，实力强大后反而灭了马哈木兄弟人马，然后把帖木儿帝国给干没了。
赛义德这个逃跑小王子也知道自己根本不是其对手，卷了些帖木儿国残余人马，主动放弃了安延集，带着人马向东而行。
赛义德打不过昔班尼，但对付察合台东部老家的那些首领们，却是绰绰有余，此时天山南部的首领们残暴，早就内部矛盾重重，局势不稳，他带着四千余人马，各个击破，先取英吉沙，再夺叶尔羌。
赛义德在叶尔羌建立起自己的汗国，被称为叶尔羌汗国，而他的兄长满速儿汗早因不敌昔班尼而退到了吐*番一带。
当时是正德年间。
东察合台汗国虽然因为马哈木被昔班尼攻灭，使的只剩下东部，可赛义德的称汗，又使的东察合台再次分为东西两部。
可叶尔羌建立后，赛义德汗在完成对天山南部诸地的统一后，却并没有向东部拓展，攻灭其兄长的意思，反而派人主动联络，希望双方友好相处。
满速儿汗实力不及弟弟，也只得默认其对天山南部各城统治，双方在阿克苏和库车之间的阿尔巴特会盟，赛义德表示会以满速儿汗的名字铸钱以示臣服，而满速儿汗则不追究赛义德以往，承认现状。
不过实际上东察合台仍处于分裂状态，当时的情况，只不过是满速儿实力不够，打不过弟弟。而赛义德多年逃亡生活，好不容易攒点本钱，却仍受到昔班尼的极大威胁，这时也不敢再跟哥哥内斗，只想闷声埋头发展壮大。
此次会盟后，兄弟俩各率人马，开始对周边地区进行征伐，以拓展自己势力范围，加强实力。
他们兄弟俩都打着战之名，满速儿汗因为西征无路，就只好向东征服，跟明朝争夺哈密地区的控制权，此时明朝无暇西顾，于是嘉裕关以西，哈密和关西七卫之地尽为满速儿汗所夺。
而赛义德则率部占据了天山北部的草原地带，后来乘昔班尼汗去世，汗国动荡之机，率军西征，连夺诸城，之后又以战之名，向西南方向扩张，吞并了克*米尔、拉达克等地，甚至还派兵去攻打喇萨。
嘉靖十二年，这位逃跑能手，到晚年也终于成了天山一霸，拳打天山南北，脚踢葱岭东西，还带着远征军跑去打喇萨，结果因年纪大了，高原反应严重，最后在赶到喇萨城下前就死掉了。
其子阿不都·拉什德继位，满速儿汗闻讯，终于有胆子发兵西征，结果却失败而归。
满速汗抑郁而终，长子继位，汗国东西两地再次开始陷入长时间的攻伐动荡之中。
阿不都·拉什德为巩固个人统治，上台之初，就大肆捕杀老臣宿将，还竭力削弱都格拉特埃米尔的权力，对外则联盟昔班尼人来对付哈萨克人，并数次将他们击败，同时，西征安延集、东讨吐*番，战争不断。
也算是个天山小霸王。
他死后，儿子阿不都·哈林继承汗位，虽然汗国实力强劲，可这位汗王能力平庸，不能服众。
东部吐*番沙汗也是统治日渐衰弱，后来北征瓦剌时，沙汗死于流矢，沙汗的叔伯弟檀速马速继位，叶尔羌的阿不都、哈林不满，派他的弟弟们出兵攻占吐*番，俘虏了速檀马速汗。
哈林立自己弟弟马黑麻速檀为吐*番总督，算是正式统一了东察合台，同年，马黑麻速檀还以吐*番王的名义遣使大明朝贡，正式让大明与叶尔羌建立联系。
哈林死后，其弟吐*番总督入继大统，在任时，也将其弟阿都剌因派驻吐*番为总督，又分其诸子孙镇守各地，从而建立起自己家族统治。
不过在其死后，其子阿黑麻速檀继承汗位后，形势却急剧逆转，因为阿黑麻速檀并非长子，与蒙古传统的长者为汗原则相背离，汗国开始动荡。
在此期间，东部的阿都剌因火中取栗，向西扩张，夺取了焉耆等地实际控制权，公开称汗，与侄子对峙。
此后王族大乱斗，在各地担任总督的王族们你攻我伐，上演了一出叶尔羌汗国的八王之乱。
六十年间换了九汗，在位最短的一位汗只当了九天，还有一位汗在被赶下汗位后，时隔三年还上演了一出王者归来，夺回汗位，又当了三年。
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