除了编制这套全书之外，肖天健还告知宋应星他们这些受命的官员们，在编制这套全书的同时，还要想办法研究，将各种工艺尽可能的量化，不要动辄便用什么这少许，那少许的字眼来代替，而且要想办法弄清楚为什么这些技术产生的根本原因。
中国许多技术的发展，都是通过不断的摸索尝试之后产生出来的，但是这样的方法仅仅是达到了目的，却并未发展成学科，许多发明这些技术的人，也仅仅是知其然却不知其所以然，结果是技术不能带动学科的发展。
对于这件事，在朝中又引起了一番争论，内阁大臣们和许多官员们认为现如今大中朝新立，正是到处都需要用人用钱的时候，肖天健提出搞这么宏大的工程，有浪费人力和财力的嫌疑，提出将编纂《大中天工全书》这件事延后个十年八年再说，到时候大中朝彻底稳定下来了，要钱有钱，要人有人，再做这件事也不迟。
但是肖天健却认为，这不是拖延的理由，即便是眼下条件有限，但是这件事也是越早开展越好，哪怕是人手不够，财力不够，这件事也要先办起来再说，让宋应星先主持这件事开展起来，逐步的完善，时间甚至可以拉长一些，但是这件事必须要先开展起来。
于是宋应星在受命之后，非常兴奋，立即便选了几十个人手，开始了前期的准备工作，将这套全书先构架起来，一部分人负责整理各种相关的古籍，一部分人则立即分赴各地搜集整理各种行业的技术。
户部方面为此按照肖天健的要求，也拨发了第一批的资金，作为他们的启动的资金，虽然资金数被内阁一下砍掉了一大半，但是肖天健也知道户部的难处，现在需要花钱的地方实在是太多了，故此内阁商议之后砍掉一大半的费用，他也没有过分坚持，而是退让了一部，采纳了内阁的意见。
这件事也让内阁体会到了肖天健这个皇帝对于他们意见的重视，从某种程度上来说，肖天健这个强势的皇帝，已经开始对内阁权力进行了一定程度上的妥协，这令内阁大臣们都很是高兴，于是这件事就在这样的情况下逐步的开展了起来。
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